Bienvenue au LYMIC

Lyon Multiscale Imaging Center

Présentation du LYMIC

Lyon Multiscale Imaging Center est une plate-forme de microscopie ouverte aux acteurs de la recherche académique et privée. Elle fédère trois pôles d'imagerie de l'agglomération lyonnaise proposant des outils d'imagerie multi-échelle, photonique et électronique :

  • Le PLATIM, implanté dans les locaux de l'Ecole Normale Supérieure de Lyon et de la Faculté de Médecine Lyon-Sud propose une offre large en microscopie photonique, depuis la microscopie conventionnelle avec des postes de vidéo-microscopie entièrement automatisés, à la microscopie confocale et bi-photonique. Le PLATIM dispose également d’un plateau à force atomique pour la réalisation de mesures 3D à haute résolution et mesures micro/nano-mécaniques.
  • Le Centre Technologique des Microstructures CTµ, situé sur le campus LyonTech - la Doua, est une plate-forme d'imagerie pluridisciplinaire à l’interface entre la Biologie, la Chimie et la Physique. Le CTµ offre un accès à des équipements performants en microscopie électronique à balayage et en transmission ainsi qu’en microscopie confocale, avec en outre une spécificité dans le domaine des cryo-méthodes pour la préparation et l’observation d’échantillons à basse température.
  • le Centre d'Imagerie Quantitative Lyon-Est (CIQLE), implanté dans les locaux de la faculté de médecine Rockefeller propose à la communauté bio-médicale une offre de microscopie photonique (microscopie photonique confocale et plein champ), électronique en transmission et histologie

Ces trois sites proposent l'accès aux différents équipements en location (utilisation autonome après formation), des stages de formation (formation continue), ainsi qu’un service de prestations capable de prendre en charge des études à façon.

L'équipe assure également une assistance personnalisée (de la technique à l'interprétation des résultats), une veille technologique et le développement de nouvelles applications.

France Bio Imaging
Nous sommes ravis et fiers de vous annoncer que LyMIC et ISDV ont officiellement rejoint France Bio Imaging en tant que nouveau nœud Rhône-Alpin. Cette reconnaissance concrétise un travail d'équipe soutenu par l'engagement profond de nombreuses personnes, renforçant ainsi notre détermination et notre motivation.
Club d'analyse d'images
A l'initiative de Marine Breuilly et avec le soutien du Lymic et du Labex Cortex
Installation d’un nouveau scanner de lames au CIQLE
Le microscope Zeiss Axioscan 7 numérise jusqu’à 100 lames de microscopie en champ clair, en lumière polarisée et en fluorescence avec des objectifs X5, X10, X20 et X40. Il image de façon automatisée toutes les colorations histologiques en lumière blanche ou polarisée (HE, HPS, PAS, trichrome de Masson, crésyl violet, picro sirius red...) et jusqu’à 7 fluorophores différents en fluorescence de l’UV à l’infra-rouge (DAPI, FITC, GFP, Cy3, DsRed, mPlum, mCherry, Cy5, Cy7). Piloté par la dernière version du logiciel Zen, ce microscope vient suppléer l’Axioscan Z1 du CIQLE dont le planning est proche de la saturation. De plus, il apporte de nouvelles fonctionnalités grâce à son nouveau polariseur circulaire et sa nouvelle source fluorescente.
Cet équipement a été cofinancé par l’Université Lyon 1 (AAP 2021 « équipement de recherche ») et la région Auvergne-Rhône-Alpes (IRICE). Il est situé au CIQLE (SFR Santé Lyon-Est, LyMIC).
Nouveau scanner de lames au CIQLE
Installation d’un nouveau microscope STED 3D super-résolution au CIQLE
Le microscope Expert Line d’Abberior est issu des travaux du laboratoire de S W. Hell (prix Nobel 2014). Il permet de descendre sous la barrière de résolution de la microscopie photonique grâce à l’imagerie STED et d’atteindre une « super-résolution » (résolution latérale inférieure à 30 nm en 2D et de l’ordre de 75 nm en 3D). Le microscope fonctionne également en microscopie confocale traditionnelle mais bénéficie d’un module d’optique adaptative qui corrige les aberrations dues aux différences d'indices de réfraction et améliore la profondeur de pénétration, une caractéristique très intéressante pour une meilleure observation des spécimens épais. Des acquisitions multi-couleur STED et/ou confocales sont possibles grâce à 4 lasers d’excitation (405, 485, 561 et 640 nm), deux de déplétion (775 et 595 nm) et 4 détecteurs de fluorescence à haut rendement quantique. L’illumination adaptative, unique à ce système, permet de préserver la fluorescence de l’échantillon en dosant de façon dynamique la puissance laser appliquée à chaque pixel. Cette technologie est particulièrement adaptée au vivant car elle réduit les effets toxiques de la lumière sur l’échantillon et limite le photo-blanchiment des sondes.
En résumé, ce microscope est un outil polyvalent qui donne accès à une rupture technologique permettant d’imager des échantillons biologiques avec une résolution jusqu’à présent hors d’atteinte en microscopie photonique.
Cet équipement a été cofinancé par l’Université Lyon 1, la région Auvergne-Rhône-Alpes (IRICE) et IBISA. Il est situé au CIQLE (SFR Santé Lyon-Est, LyMIC).
Installation d’un nouveau microscope STED 3D super-résolution au CIQLE

Le LYMIC en chiffres

80

Equipements

18

Personnels

32949

Heures d'utilisation des équipements en 2021

Pôles d'imagerie

Contact

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Accès

Lyon Multiscale Imaging Center comporte trois pôles répartis sur cinq sites, ils sont ouverts à l'ensemble de la recherche académique et privée et proposent aux utilisateurs conseil, encadrement et formation à l'utilisation des machines selon une charte commune et avec une tarification harmonisée des prestations.

cnrs